北京大學(xué)腫瘤醫(yī)院設(shè)有36個臨床科室，14個醫(yī)技科室，10個基礎(chǔ)研究科室,4個基礎(chǔ)平臺科室,開放床位801張。全年門診量75萬人次，年收治病人9.6萬人次，手術(shù)1.7萬例。醫(yī)院職工近2600人，在編職工中正高級職稱152人，副高級職稱253人。

北京大學(xué)腫瘤醫(yī)院現(xiàn)有工程院院士1名、長江學(xué)者獎勵計劃特聘教授2名，自建院以來先后有4人獲國家自然科學(xué)基金杰出青年、11人獲突出貢獻(xiàn)專家，42人獲政府特殊津貼?，F(xiàn)有教授43名、副教授81名、博士研究生導(dǎo)師59名、碩士研究生導(dǎo)師69名。

研究所建所以來，在腫瘤學(xué)基礎(chǔ)理論研究、常見主要腫瘤的臨床診斷與、胃癌、食管癌高發(fā)區(qū)現(xiàn)場的預(yù)防干預(yù)研究等領(lǐng)域均有創(chuàng)新與的成績，在國內(nèi)外頗具影響。

北京大學(xué)腫瘤醫(yī)院與許多國際知名腫瘤研究機(jī)構(gòu)建立了密切的合作關(guān)系，每年不斷有國內(nèi)外專家學(xué)者來院參觀、考察、講學(xué)，進(jìn)行科研協(xié)作與學(xué)術(shù)交流。醫(yī)院也不斷有科研、臨床、醫(yī)技專業(yè)人員出國訪問、進(jìn)修、短期工作或參加國際學(xué)術(shù)會議。