醫(yī)院設有冠心病中心、心律失常中心、急重癥中心、心力衰竭中心、肺血管病中心、高血壓中心、臨床藥理中心、血脂異常與心血管病診治中心、內分泌與心血管病診治中心、血栓性疾病診治中心、特需醫(yī)療中心、成人外科中心、血管外科中心、小兒外科中心、術后恢復中心、麻醉中心、體外循環(huán)中心、放射影像中心、超聲影像中心、核醫(yī)學影像中心、功能檢測中心、臨床檢驗中心等臨床和醫(yī)技科室。

中國醫(yī)學科學院阜外醫(yī)院（以下簡稱阜外醫(yī)院），是三級甲等心血管病?？漆t(yī)院，目前正朝向綜合型醫(yī)院轉型發(fā)展。阜外醫(yī)院是國家心血管病中心所在地，是心血管疾病國家重點實驗室、國家心血管疾病臨床醫(yī)學研究中心建設承擔單位，是獲得全國首批“輔導類”國家醫(yī)學中心和全國國家醫(yī)學中心實質落地項目建設單位，以診治各種復雜、疑難和重癥心血管疾病而享譽國內外，已成為世界上的心血管疾病診治中心和集醫(yī)療、科研、預防和人才培養(yǎng)于一體的醫(yī)學研究與教育中心。

開創(chuàng)中國心血管病防治事業(yè)

阜外醫(yī)院心血管病流行病學防治研究工作始于1959年。1978年建立了中國個心血管病流行病學研究室，是我國個從事心血管病流行病學和人群防治研究的專業(yè)研究室。2000年成立群體遺傳學及防治研究室，在我國心血管人群防治基礎上開拓了新的遺傳流行病學的發(fā)展領域。2004年9月衛(wèi)生部心血管病防治研究中心落戶阜外，具體負責推動全國的心血管病防治和研究工作。2013年國家心血管病中心投入實質運營，軟硬件設施得到極大改善，心血管疾病防治工作站上了更高平臺。

加強心血管防治新體系建設

阜外醫(yī)院始終以“心血管病高危人群早期篩查與綜合干預項目”“國家基層高血壓管理防治管理項目”“三高（高血壓、高血糖、高脂血癥）共管項目”“中國居民心血管病及其危險因素監(jiān)測項目”四大國家項目為媒介，提升基層衛(wèi)生服務能力。

心血管病高危人群早期篩查與綜合干預項目自2014年啟動，十年間累計篩查社區(qū)居民超過524.7萬人次，檢出心血管病高危對象146.4萬人，并完成風險監(jiān)測干預隨訪465.7萬人次。